Truyện tranh "Tình yêu vị Pocky" xoay quanh hai nhân vật chính là Kaito - chàng học sinh nổi tiếng với vẻ ngoài lạnh lùng và Takeru - anh chàng hòa bình, luôn lấy niềm vui của người khác làm niềm vui của mình. Họ có một mối quan hệ đặc biệt, từ khi lần đầu gặp nhau trên mái trường với chiếc bánh Pocky kết nối tình cảm của họ.
Khi một sự cố bí ẩn xảy ra tại trường, Kaito và Takeru buộc phải hợp tác để giải quyết. Dần dần, họ nhận ra rằng điểm chung không chỉ là Pocky mà còn là sự hiểu biết sâu sắc về nhau. Khi bí ẩn dần được hé lộ, họ phát hiện ra rằng mọi chuyện không hề như họ tưởng.
Tình yêu và sự hiểu biết dần mở ra giữa hai trái tim, đồng thời những đau khổ và khát khao cũng bắt đầu hiện rõ. Kaito và Takeru phải đối mặt với quá khứ đau thương, những bí mật kinh hoàng và sự thật không ngờ đến. Liệu tình yêu vị Pocky liệu có đủ mạnh để vượt qua mọi khó khăn, hay chỉ là một cái bóng mờ mịt của quá khứ đen tối.
