Trong một ngày mưa phùn ảm đạm, cậu bé Taki bước chân vào lớp học với ánh mắt lặng thinh và biểu cảm u buồn. Hắn luôn tự cho mình là người đứng sau trong mọi cuộc chơi; từ khi lên 3 tuổi, Taki đã cảm thấy bị lãng quên và bỏ lại phía sau. Tuy vậy, một điều bí mật duy nhất của cậu là chiếc hộp nhỏ bí ẩn mà hắn luôn giữ kín.
Một ngày, hộp bí ẩn của Taki bất ngờ biến mất mà không để lại dấu vết nào. Câu chuyện bắt đầu từ đây, khi cậu nhận ra rằng hộp đó chứa đựng một quyển ghi chú với dòng chữ viết tay lạ lẫm. Bất chấp sự hoang mang, Taki vụt mở nó và nghe những lời nói bí ẩn từ đâu đó bên trong.
Những thông điệp ẩn chứa trong quyển ghi chú khiến cho cuộc sống của Taki bị đảo lộn ngược lạc. Những bí mật ẩn sau vẻ ngoài bình thường của cậu bắt đầu hé lộ, kéo theo chuỗi sự kiện khó lường, đưa Taki vào một hành trình khám phá hàng ngàn bí ẩn ẩn chứa đằng sau sự thật mà hắn từng biết. Cậu bé phát hiện ra rằng, bản thân mình là chìa khóa cuối cùng để mở ra cánh cửa của một thế giới mới, nơi mà 24 giờ cuộc đời cậu sẽ thay đổi mãi mãi.
